Anatomi tumbuhan adalah disiplin ilmu yang terinci, merupakan salah satu bagian botani yang tertua. Keuntungan disiplin ilmu yang tua ini adalah banyaknya aspek dasar morfologi yang telah ditemukan, ditafsirkan serta diterangkan. Dengan demikian dapat dikatakan bahwa anatomi tumbuhan merupakan landasan dari ilmu terapan seperti hortikultura, agronomi, patologi, maupun ekologi.